Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms