Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

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Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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HIF3AQ9Y2N7 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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HIF3AQ9Y2N7 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HIF3AQ9Y2N7 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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