Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KDM2AQ9Y2K7 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KDM2AQ9Y2K7 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms