Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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RCE1Q9Y256 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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RCE1Q9Y256 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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RCE1Q9Y256 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RCE1Q9Y256 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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