Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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USP18Q9UMW8 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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USP18Q9UMW8 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
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USP18Q9UMW8 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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USP18Q9UMW8 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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USP18Q9UMW8 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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USP18Q9UMW8 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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USP18Q9UMW8 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
USP18Q9UMW8 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
USP18Q9UMW8 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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