Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MLH3Q9UHC1 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms