Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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COPS7AQ9UBW8 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS7AQ9UBW8 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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