Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPASTQ9UBP0 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms