Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
REREQ9P2R6 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms