Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EHD3Q9NZN3 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms