Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0G0

ZNF407, Zinc finger protein 407, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF407Q9C0G0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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ZNF407Q9C0G0 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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ZNF407Q9C0G0 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ZNF407Q9C0G0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ZNF407Q9C0G0 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ZNF407Q9C0G0 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ZNF407Q9C0G0 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ZNF407Q9C0G0 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ZNF407Q9C0G0 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ZNF407Q9C0G0 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ZNF407Q9C0G0 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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ZNF407Q9C0G0 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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ZNF407Q9C0G0 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF407Q9C0G0 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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