Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SNHG12Q9BXW3 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms