Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PLVAPQ9BX97 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms