Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
HIGD2AQ9BW72 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms