Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVT8

TMUB1, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB1Q9BVT8 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 AL157702.2-201ENST00000428292 1223 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 AC239868.3-201ENST00000577853 1234 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 PAICSP2-201ENST00000429118 1150 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TMUB1Q9BVT8 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms