Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPRUQ92729 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRUQ92729 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms