Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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PHF3Q92576 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PHF3Q92576 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PHF3Q92576 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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