Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
APOBEC4Q8WW27 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms