Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHG7

SVIP, Small VCP/p97-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVIPQ8NHG7 Z98259.1-201ENST00000564261 1697 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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SVIPQ8NHG7 PHF8-201ENST00000322659 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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SVIPQ8NHG7 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 SYNRG-229ENST00000621136 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 ZCCHC14-201ENST00000268616 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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SVIPQ8NHG7 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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SVIPQ8NHG7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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SVIPQ8NHG7 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 RPS6KA2-203ENST00000405189 2282 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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SVIPQ8NHG7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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SVIPQ8NHG7 ZNF571-206ENST00000593133 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 MARCH10-201ENST00000311269 3090 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 AC007638.1-201ENST00000576751 1763 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 CLPB-201ENST00000294053 3240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
SVIPQ8NHG7 ATF4P4-201ENST00000393544 1930 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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