Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF248Q8NDW4 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms