Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ZIC4Q8N9L1 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms