Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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C9orf40Q8IXQ3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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C9orf40Q8IXQ3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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C9orf40Q8IXQ3 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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C9orf40Q8IXQ3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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C9orf40Q8IXQ3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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C9orf40Q8IXQ3 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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C9orf40Q8IXQ3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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C9orf40Q8IXQ3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C9orf40Q8IXQ3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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