Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KCNMB4Q86W47 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms