Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FRMPD1Q5SYB0 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FRMPD1Q5SYB0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms