Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCID2Q5JVF3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCID2Q5JVF3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms