Protein–RNA interactions for Protein: Q2I0M5

RSPO4, R-spondin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO4Q2I0M5 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RSPO4Q2I0M5 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RSPO4Q2I0M5 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RSPO4Q2I0M5 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RSPO4Q2I0M5 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RSPO4Q2I0M5 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RSPO4Q2I0M5 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RSPO4Q2I0M5 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RSPO4Q2I0M5 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RSPO4Q2I0M5 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RSPO4Q2I0M5 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RSPO4Q2I0M5 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RSPO4Q2I0M5 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RSPO4Q2I0M5 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RSPO4Q2I0M5 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RSPO4Q2I0M5 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RSPO4Q2I0M5 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RSPO4Q2I0M5 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RSPO4Q2I0M5 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RSPO4Q2I0M5 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RSPO4Q2I0M5 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RSPO4Q2I0M5 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RSPO4Q2I0M5 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RSPO4Q2I0M5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RSPO4Q2I0M5 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RSPO4Q2I0M5 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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