Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCDC142Q17RM4 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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