Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IMPG1Q17R60 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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