Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC18A3Q16572 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A3Q16572 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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