Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC1Q15915 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC1Q15915 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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