Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF2Q15853 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF2Q15853 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
USF2Q15853 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF2Q15853 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
USF2Q15853 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
USF2Q15853 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
USF2Q15853 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
USF2Q15853 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF2Q15853 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
USF2Q15853 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
USF2Q15853 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
USF2Q15853 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
USF2Q15853 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
USF2Q15853 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
USF2Q15853 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
USF2Q15853 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
USF2Q15853 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
USF2Q15853 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
USF2Q15853 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
USF2Q15853 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
USF2Q15853 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
USF2Q15853 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
USF2Q15853 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
USF2Q15853 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
USF2Q15853 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF2Q15853 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF2Q15853 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF2Q15853 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF2Q15853 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF2Q15853 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF2Q15853 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF2Q15853 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF2Q15853 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF2Q15853 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF2Q15853 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF2Q15853 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF2Q15853 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF2Q15853 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF2Q15853 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF2Q15853 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
USF2Q15853 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF2Q15853 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF2Q15853 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF2Q15853 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF2Q15853 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
USF2Q15853 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF2Q15853 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF2Q15853 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
USF2Q15853 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF2Q15853 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF2Q15853 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF2Q15853 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF2Q15853 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF2Q15853 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF2Q15853 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF2Q15853 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF2Q15853 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF2Q15853 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF2Q15853 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
USF2Q15853 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF2Q15853 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF2Q15853 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF2Q15853 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF2Q15853 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF2Q15853 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF2Q15853 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF2Q15853 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF2Q15853 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF2Q15853 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF2Q15853 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
USF2Q15853 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF2Q15853 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
USF2Q15853 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF2Q15853 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF2Q15853 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF2Q15853 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF2Q15853 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF2Q15853 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF2Q15853 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF2Q15853 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF2Q15853 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF2Q15853 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF2Q15853 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF2Q15853 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF2Q15853 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF2Q15853 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF2Q15853 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF2Q15853 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF2Q15853 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF2Q15853 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF2Q15853 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF2Q15853 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF2Q15853 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF2Q15853 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF2Q15853 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF2Q15853 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF2Q15853 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF2Q15853 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
USF2Q15853 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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