Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EEA1Q15075 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms