Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HERC3Q15034 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HERC3Q15034 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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