Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PCLAFQ15004 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PCLAFQ15004 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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