Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SPTAN1Q13813 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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