Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOFQ13790 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOFQ13790 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOFQ13790 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOFQ13790 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOFQ13790 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOFQ13790 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOFQ13790 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOFQ13790 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOFQ13790 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOFQ13790 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOFQ13790 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOFQ13790 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOFQ13790 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOFQ13790 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APOFQ13790 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOFQ13790 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOFQ13790 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOFQ13790 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOFQ13790 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOFQ13790 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOFQ13790 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOFQ13790 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOFQ13790 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOFQ13790 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOFQ13790 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOFQ13790 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOFQ13790 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOFQ13790 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOFQ13790 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOFQ13790 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOFQ13790 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOFQ13790 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOFQ13790 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOFQ13790 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOFQ13790 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOFQ13790 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOFQ13790 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOFQ13790 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOFQ13790 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOFQ13790 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOFQ13790 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOFQ13790 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOFQ13790 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOFQ13790 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOFQ13790 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOFQ13790 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOFQ13790 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOFQ13790 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOFQ13790 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOFQ13790 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOFQ13790 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOFQ13790 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOFQ13790 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOFQ13790 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOFQ13790 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOFQ13790 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOFQ13790 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOFQ13790 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOFQ13790 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOFQ13790 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOFQ13790 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOFQ13790 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOFQ13790 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOFQ13790 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOFQ13790 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOFQ13790 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOFQ13790 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOFQ13790 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOFQ13790 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOFQ13790 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOFQ13790 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOFQ13790 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOFQ13790 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOFQ13790 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOFQ13790 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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APOFQ13790 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOFQ13790 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOFQ13790 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOFQ13790 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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APOFQ13790 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOFQ13790 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOFQ13790 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOFQ13790 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOFQ13790 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
APOFQ13790 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOFQ13790 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOFQ13790 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOFQ13790 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOFQ13790 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
APOFQ13790 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOFQ13790 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOFQ13790 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOFQ13790 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
APOFQ13790 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOFQ13790 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOFQ13790 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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