Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP1A4Q13733 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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