Protein–RNA interactions for Protein: Q12982

BNIP2, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP2Q12982 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP2Q12982 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP2Q12982 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP2Q12982 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP2Q12982 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP2Q12982 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP2Q12982 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP2Q12982 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP2Q12982 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP2Q12982 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP2Q12982 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP2Q12982 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP2Q12982 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP2Q12982 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP2Q12982 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP2Q12982 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP2Q12982 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP2Q12982 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP2Q12982 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP2Q12982 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP2Q12982 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP2Q12982 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BNIP2Q12982 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BNIP2Q12982 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms