Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
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NPRL3Q12980 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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NPRL3Q12980 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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NPRL3Q12980 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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NPRL3Q12980 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NPRL3Q12980 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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