Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCB1Q12824 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMARCB1Q12824 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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