Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

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Length 949 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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AP1B1Q10567 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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AP1B1Q10567 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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AP1B1Q10567 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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AP1B1Q10567 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
AP1B1Q10567 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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