Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RASGEF1BQ0VAM2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
RASGEF1BQ0VAM2 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms