Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBQ06643 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBQ06643 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBQ06643 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBQ06643 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBQ06643 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBQ06643 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBQ06643 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBQ06643 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBQ06643 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBQ06643 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBQ06643 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBQ06643 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBQ06643 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBQ06643 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBQ06643 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBQ06643 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBQ06643 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBQ06643 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBQ06643 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBQ06643 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBQ06643 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBQ06643 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LTBQ06643 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LTBQ06643 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LTBQ06643 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LTBQ06643 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LTBQ06643 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LTBQ06643 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LTBQ06643 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LTBQ06643 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LTBQ06643 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LTBQ06643 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LTBQ06643 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LTBQ06643 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LTBQ06643 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LTBQ06643 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LTBQ06643 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LTBQ06643 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LTBQ06643 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LTBQ06643 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LTBQ06643 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
LTBQ06643 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LTBQ06643 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LTBQ06643 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LTBQ06643 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LTBQ06643 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LTBQ06643 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LTBQ06643 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LTBQ06643 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LTBQ06643 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LTBQ06643 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LTBQ06643 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LTBQ06643 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LTBQ06643 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LTBQ06643 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LTBQ06643 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LTBQ06643 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LTBQ06643 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LTBQ06643 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LTBQ06643 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LTBQ06643 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LTBQ06643 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LTBQ06643 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LTBQ06643 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LTBQ06643 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LTBQ06643 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LTBQ06643 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LTBQ06643 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LTBQ06643 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LTBQ06643 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LTBQ06643 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LTBQ06643 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LTBQ06643 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LTBQ06643 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LTBQ06643 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LTBQ06643 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LTBQ06643 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LTBQ06643 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LTBQ06643 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LTBQ06643 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LTBQ06643 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LTBQ06643 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LTBQ06643 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LTBQ06643 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LTBQ06643 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LTBQ06643 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LTBQ06643 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LTBQ06643 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LTBQ06643 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LTBQ06643 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LTBQ06643 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LTBQ06643 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
LTBQ06643 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LTBQ06643 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LTBQ06643 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LTBQ06643 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LTBQ06643 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LTBQ06643 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LTBQ06643 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms