Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GRIN1Q05586 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms