Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKL1Q00532 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKL1Q00532 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKL1Q00532 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKL1Q00532 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKL1Q00532 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKL1Q00532 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKL1Q00532 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKL1Q00532 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKL1Q00532 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKL1Q00532 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKL1Q00532 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKL1Q00532 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKL1Q00532 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKL1Q00532 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKL1Q00532 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKL1Q00532 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKL1Q00532 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKL1Q00532 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKL1Q00532 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKL1Q00532 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKL1Q00532 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKL1Q00532 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKL1Q00532 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKL1Q00532 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKL1Q00532 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKL1Q00532 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKL1Q00532 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKL1Q00532 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKL1Q00532 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms