Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTBP2P56545 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms