Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AQP4P55087 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AQP4P55087 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AQP4P55087 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AQP4P55087 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AQP4P55087 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AQP4P55087 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AQP4P55087 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AQP4P55087 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AQP4P55087 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AQP4P55087 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AQP4P55087 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AQP4P55087 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AQP4P55087 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AQP4P55087 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AQP4P55087 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AQP4P55087 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AQP4P55087 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AQP4P55087 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AQP4P55087 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AQP4P55087 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AQP4P55087 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AQP4P55087 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AQP4P55087 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AQP4P55087 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AQP4P55087 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AQP4P55087 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AQP4P55087 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AQP4P55087 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AQP4P55087 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AQP4P55087 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AQP4P55087 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AQP4P55087 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AQP4P55087 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AQP4P55087 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AQP4P55087 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AQP4P55087 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AQP4P55087 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AQP4P55087 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AQP4P55087 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AQP4P55087 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AQP4P55087 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AQP4P55087 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AQP4P55087 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AQP4P55087 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AQP4P55087 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AQP4P55087 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms