Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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PGGT1BP53609 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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PGGT1BP53609 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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PGGT1BP53609 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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PGGT1BP53609 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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PGGT1BP53609 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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PGGT1BP53609 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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PGGT1BP53609 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PGGT1BP53609 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
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