Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KPNA1P52294 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms