Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC4A3P48751 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms